国科中子BNCT设备为射频四极加速器（RFQ）驱动的硼中子俘获治疗（BNCT）医用装置，主要由RFQ加速器、中子产生系统、治疗室组成，用于治疗脑胶质瘤、头颈癌、黑色素瘤等x射线、质子、重离子以及手术难以治疗的癌症。该装置原理是由一台2.8MeV的RFQ加速器提供强流质子束，质子束经束流传输线，打锂靶产生高通量的中子，经过慢化器、反射体以及中子整形体（BSA），在治疗软件的控制下完成治疗。
国科中子BNCT设备采用一器多终端的方案，一台治疗端处于供束治疗期间，其余治疗端无束流传输，为患者摆位做准备，以提高加速器使用效率。
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